利用openvibe做简单的离线脑电数据处理

   日期:2020-09-09     浏览:261    评论:0    
核心提示:#本篇由BCIduino脑机接口开源社区整理(公众号“BCIduino脑机接口社区”)利用openvibe做数据处理前,应该首先关注几个点:OpenVibe Designer提供了几个处理框,如采集和网络IO、分类、评估等,其中任何一个都可以连接成一个节点,用于根据应用程序处理EEG数据。重要的是连接块的输入输出必须在数据类型中匹配,否则仿真将显示错误。对于脑电信号的离线处理,需要将加载到采集客户端的数据存储在某个地方。这可以通过文件读写模块来实现,该模块包括CSV文件写入器、EDF(欧洲数据格式).
  • #本篇由BCIduino脑机接口开源社区整理(公众号“BCIduino脑机接口社区”)
    利用openvibe做数据处理前,应该首先关注几个点:
  • OpenVibe Designer提供了几个处理框,如采集和网络IO、分类、评估等,其中任何一个都可以连接成一个节点,用于根据应用程序处理EEG数据。重要的是连接块的输入输出必须在数据类型中匹配,否则仿真将显示错误。
  • 对于脑电信号的离线处理,需要将加载到采集客户端的数据存储在某个地方。这可以通过文件读写模块来实现,该模块包括CSV文件写入器、EDF(欧洲数据格式)文件写入器、GDF(通用数据格式)文件读取器/写入器等。类似地,还有一个通用流读写器,可以从.ov(openvibe)文件格式读取/存储任意数量的流。所有这些模块都可以通过直接连接到采集客户端来读取实时数据,并可以将数据分别存储在用户设置的所需位置上的.csv文件、.edf文件和.gdf文件格式。例如,客户端采集的脑电数据,通过与CSV文件写入器连接,可以存储在计算机磁盘中,如图1所示。可以通过双击CSV file writer框来设置存储路径。这样形成的文件可以在microsoft excel中打开。某一段静息状态下产生的脑电CSV文件如图2所示。

    图1 将脑电数据存储为CSV文件格式

    图2 正常静息状态生成的CSV文件
  • Designer中可用的大多数处理模块只处理.ov(openvibe)文件格式。因此,如果数据存储在.csv文件中,则需要将其转换为.ov文件。这可以通过Openvibe的转换器模板来实现,Open工具可以从文件菜单访问这些模板。也可以从同一路径中的Box教程访问几个就绪处理模板。
  • 任何模块的输入/输出都可以添加/删除,其数据类型可以通过右键单击来修改。脑电数据的各种数据类型有特征向量、信号流矩阵、信号、频谱、实验信息、刺激等,如频谱分析模块的数据类型必须设置为频谱。通过双击方框,可以配置块并更改其参数。
  • 大多数研究者试图通过研究脑电信号的频谱特征来分析脑电信号,openvibe提供各种模块,如信道选择器、平均、滤波、Epoching等。例如,为了分离Delta波段,观察其功率谱显示(PSD)并计算其频谱平均值,可以使用图3所示的处理流程,其中,配置时间滤波器块来设置δ带(0.5-3hz)的截止频率。这里,使用了巴特沃斯带通滤波器。δ波段的PSD如4所示,并且可以把含有频谱平均值的数据保存成csv文件。

    图3 计算了Delta波段的PSD和频谱平均值。

    图4 δ波段的PSD

此外,Openvibe还为特征分类和openvibe VRPN(虚拟现实外围网络)的连接提供了现成的模板。这些模板需要根据具体应用进行修改。
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